Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL38Q2WGJ6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms