Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms