Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms