Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCM1Q15154 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCM1Q15154 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCM1Q15154 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCM1Q15154 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PCM1Q15154 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PCM1Q15154 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PCM1Q15154 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms