Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHAF1BQ13112 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms