Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms