Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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