Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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