Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms