Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms