Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP1B3P54709 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms