Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms