Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms