Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms