Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms