Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JAK1P23458 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
JAK1P23458 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JAK1P23458 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JAK1P23458 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms