Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GCSHP23434 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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