Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATF3P18847 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF3P18847 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATF3P18847 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF3P18847 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF3P18847 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms