Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD4O60885 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD4O60885 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD4O60885 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD4O60885 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD4O60885 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD4O60885 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD4O60885 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD4O60885 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms