Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN4O43707 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms