Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIP1O00291 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIP1O00291 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIP1O00291 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIP1O00291 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms