Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NOTOA8MTQ0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms