Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF839A8K0R7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms