Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms