Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms