Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms