Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms