Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms