Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHDC1Q9NTX5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms