Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms