Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB18Q9NP72 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms