Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms