Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAL3ST1Q99999 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms