Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms