Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPUSD4Q96CM3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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