Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA6DQ8NFY4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms