Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TMCO5AQ8N6Q1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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TMCO5AQ8N6Q1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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TMCO5AQ8N6Q1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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TMCO5AQ8N6Q1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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TMCO5AQ8N6Q1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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TMCO5AQ8N6Q1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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