Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC103Q8IW40 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms