Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDZRN4Q6ZMN7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDZRN4Q6ZMN7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms