Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4L3Q6VB84 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXD4L3Q6VB84 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms