Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RWDD4Q6NW29 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms