Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF6Q5VXH4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms