Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms