Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTXN3Q4LDR2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms