Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECM1Q16610 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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