Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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CCDC6Q16204 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CCDC6Q16204 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CCDC6Q16204 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CCDC6Q16204 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CCDC6Q16204 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CCDC6Q16204 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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