Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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