Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK1Q15118 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms