Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB3GAP1Q15042 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3GAP1Q15042 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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