Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE7AQ13946 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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